История компании началась в 1995 году, с объединения крупнейших нефтяных предприятий страны (ОАО «Ноябрьскнефтегаз», ОАО «Ноябрьскнефтегазгеофизика», ОАО «Омский нефтеперерабатывающий завод» и ОАО «Омскнефтепродукт») в ОАО«Сибирская нефтяная компания». Учредителем общества стало государство.
В 2005г. контрольный пакет акций ОАО «Сибирская нефтяная компания» приобрела Группа «Газпром», и с 13 мая 2006г. компания переименована в ОАО «Газпром нефть», основными видами деятельности которой являются разведка, разработка, добыча и реализация нефти и газа, а также производство и сбыт нефтепродуктов.
Организационная структура ОАО «Газпром нефть» включает в себя длинный список дочерних компаний, каждая из которых выполняет определенную задачу - от добычи ресурсов, переработки, транспортировки и до реализации. Органом управления ОАО «Газпром нефть» является Общее собрание акционеров, которое формирует Совет директоров. Ежедневную оперативную работу Компании обеспечивает исполнительный орган - Генеральный директор и Правление.
Стремление «Газпром нефти» стать крупным международным предприятием подтверждается задачами, которые компания перед собой ставит. К 2020г. «Газпром нефть» намерена увеличить объемы добычи нефти до 100 млн. тонн н. э. в год, а продажа должна достигнуть 40 млн. тонн нефтепродуктов через маржинальные каналы сбыта в России и за рубежом, наращивать реализацию нефтепродуктов через АЗС на территории России, увеличивать количество действующих АЗС.
По итогам 2011 года «Газпром нефть» остается одним из лидеров нефтяной отрасли в России.
Председатель Совета директоров - Миллер Алексей Борисович.
Председатель Правления, Генеральный директор ОАО «Газпром нефть» - Дюков Александр Валерьевич.